Věda za systémy FCU využívá základní principy fyziky, zejména termodynamické zákony, které řídí procesy související s přenosem tepla, jako je vedení a konvekce. K absorpci tepla dochází prostřednictvím jeho spirály, když se chladivo odpařuje a ochladí se během režimu chlazení.
Pokud jde o praktické důsledky, systém FCU má pohyb vzduchu a chladiva. V režimu chlazení odebírá z tohoto prostoru teplejší vzduch a fouká ho přes spirálu. Proto chladivo odebírá ze vzduchu teplo a tím jej ochlazuje.
Tento chladný vzduch je pak recirkulován do místnosti a účinně ji ochlazuje. V režimu vytápění je však použit opačný proces. Teplo se odebírá z chladiva přes spirálu a přenáší se do vzduchu, kde se ohřívá, než se vypustí zpět do místnosti.